Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms