Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm7933-201ENSMUST00000191215 2255 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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