Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

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Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PtprbB2RU80 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PtprbB2RU80 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PtprbB2RU80 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PtprbB2RU80 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PtprbB2RU80 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PtprbB2RU80 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PtprbB2RU80 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PtprbB2RU80 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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PtprbB2RU80 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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