Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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