Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPL23P62829 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPL23P62829 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPL23P62829 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms