Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms