Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Mgst2-201ENSMUST00000099106 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc9Q8CDN9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms