Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms