Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFTRP13569 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFTRP13569 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFTRP13569 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms