Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn10Q9ESK3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn10Q9ESK3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms