Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp5sQ9CRA7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms