Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF25Q9BQ70 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF25Q9BQ70 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF25Q9BQ70 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF25Q9BQ70 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF25Q9BQ70 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms