Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtn4Q99P72 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtn4Q99P72 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms