Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms