Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms