Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 UBP7YIL156W 3216 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 JIP5YPR169W 1479 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 GDE1YPL110C 3672 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 BIK1YCL029C 1323 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 BOP2YLR267W 1713 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 MRT4YKL009W 711 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 YMR130WYMR130W 909 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 CLF1YLR117C 2064 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 ARG4YHR018C 1392 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 MRPL7YDR237W 879 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 YDR271CYDR271C 372 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 SKG6YHR149C 2205 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 RIP1YEL024W 648 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 CLA4YNL298W 2529 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 NUP2YLR335W 2163 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 RMD1YDL001W 1293 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 BNA1YJR025C 534 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 YML131WYML131W 1098 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 MET3YJR010W 1536 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 JLP1YLL057C 1239 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 YLR049CYLR049C 1287 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1B-ORQ92393 COX19YLL018C-A 297 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 DAL4YIR028W 1908 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 URA4YLR420W 1095 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 AAP1YHR047C 2571 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 CDC4YFL009W 2340 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 ERG7YHR072W 2196 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 FUN30YAL019W 3396 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 CMK1YFR014C 1341 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 Q0182Q0182 405 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 HSP104YLL026W 2727 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 YEN1YER041W 2280 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 POF1YCL047C 777 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 LCB2YDR062W 1686 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 MDL1YLR188W 2088 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 YNR061CYNR061C 660 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 NUP1YOR098C 3231 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 CHK1YBR274W 1584 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 OAR1YKL055C 837 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 CAT5YOR125C 702 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 NOG1YPL093W 1944 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 ADE6YGR061C 4077 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 PPG1YNR032W 1107 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 CDC15YAR019C 2925 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 PEX30YLR324W 1572 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1B-ORQ92393 DAL81YIR023W 2913 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 NRK1YNL129W 723 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 PBN1YCL052C 1251 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 RAD2YGR258C 3096 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 LCB5YLR260W 2064 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 YLR296WYLR296W 327 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 CTT1YGR088W 1689 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 ALG9YNL219C 1668 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 NMT1YLR195C 1368 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 ALT2YDR111C 1524 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 AGE2YIL044C 897 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 TSL1YML100W 3297 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 STE23YLR389C 3084 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 PRD1YCL057W 2139 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 TRM8YDL201W 861 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 SFK1YKL051W 1062 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 SDO1YLR022C 753 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 COQ5YML110C 924 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 UBP10YNL186W 2379 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 ARC40YBR234C 1155 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 HXT7YDR342C 1713 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 HXT6YDR343C 1713 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 MSB2YGR014W 3921 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 YDR056CYDR056C 618 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 YEL074WYEL074W 339 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 GLE2YER107C 1098 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 TIM12YBR091C 330 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 TGL4YKR089C 2733 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 SOL4YGR248W 768 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 GPP1YIL053W 753 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 MAD2YJL030W 591 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 RPS1BYML063W 768 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 IMP4YNL075W 873 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 MRP21YBL090W 534 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 DIN7YDR263C 1293 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 YBL036CYBL036C 774 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 YIM1YMR152W 1098 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-ORQ92393 SLN1YIL147C 3663 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 SKP2YNL311C 2292 nt5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.7 ms