Protein–RNA interactions for Protein: Q91WT9

Cbs, Cystathionine beta-synthase, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbsQ91WT9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CbsQ91WT9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbsQ91WT9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CbsQ91WT9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms