Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDD1Q8TEB9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms