Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pan3Q640Q5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms