Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PERM1Q5SV97 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms