Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sun3Q5SS91 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sun3Q5SS91 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sun3Q5SS91 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.7 ms