Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc2Q3SXD3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms