Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hif3aQ0VBL6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms