Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms