Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpina1cQ00896 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms