Protein–RNA interactions for Protein: P97861

Krt86, Keratin, type II cuticular Hb6, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt86P97861 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt86P97861 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt86P97861 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt86P97861 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt86P97861 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt86P97861 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Krt86P97861 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt86P97861 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms