Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nbr1P97432 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nbr1P97432 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nbr1P97432 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nbr1P97432 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms