Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf13P61216 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms