Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB4P54760 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms