Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK7P50613 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK7P50613 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK7P50613 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK7P50613 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK7P50613 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK7P50613 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK7P50613 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK7P50613 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK7P50613 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK7P50613 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK7P50613 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK7P50613 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK7P50613 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK7P50613 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK7P50613 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK7P50613 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK7P50613 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK7P50613 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK7P50613 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK7P50613 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK7P50613 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK7P50613 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK7P50613 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK7P50613 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK7P50613 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK7P50613 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK7P50613 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK7P50613 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK7P50613 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK7P50613 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK7P50613 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK7P50613 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK7P50613 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK7P50613 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK7P50613 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK7P50613 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK7P50613 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK7P50613 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK7P50613 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK7P50613 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK7P50613 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK7P50613 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK7P50613 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK7P50613 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK7P50613 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK7P50613 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK7P50613 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK7P50613 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK7P50613 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK7P50613 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK7P50613 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK7P50613 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK7P50613 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK7P50613 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK7P50613 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK7P50613 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK7P50613 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK7P50613 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK7P50613 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK7P50613 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK7P50613 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK7P50613 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK7P50613 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK7P50613 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK7P50613 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK7P50613 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK7P50613 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK7P50613 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK7P50613 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK7P50613 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK7P50613 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK7P50613 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK7P50613 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK7P50613 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK7P50613 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK7P50613 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK7P50613 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK7P50613 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK7P50613 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK7P50613 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms