Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRIM1P49642 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRIM1P49642 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms