Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTBP49356 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTBP49356 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTBP49356 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTBP49356 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTBP49356 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTBP49356 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTBP49356 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTBP49356 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTBP49356 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTBP49356 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTBP49356 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTBP49356 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTBP49356 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTBP49356 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTBP49356 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTBP49356 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTBP49356 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTBP49356 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTBP49356 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTBP49356 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTBP49356 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTBP49356 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTBP49356 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTBP49356 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTBP49356 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTBP49356 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTBP49356 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTBP49356 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTBP49356 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTBP49356 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTBP49356 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTBP49356 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTBP49356 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTBP49356 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTBP49356 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTBP49356 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTBP49356 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTBP49356 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTBP49356 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTBP49356 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTBP49356 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTBP49356 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTBP49356 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTBP49356 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTBP49356 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTBP49356 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTBP49356 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTBP49356 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTBP49356 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTBP49356 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTBP49356 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTBP49356 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTBP49356 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTBP49356 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTBP49356 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTBP49356 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTBP49356 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTBP49356 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTBP49356 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTBP49356 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTBP49356 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTBP49356 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTBP49356 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTBP49356 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTBP49356 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTBP49356 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNTBP49356 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTBP49356 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTBP49356 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTBP49356 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTBP49356 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTBP49356 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTBP49356 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTBP49356 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms