Protein–RNA interactions for Protein: P48758

Cbr1, Carbonyl reductase [NADPH] 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbr1P48758 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbr1P48758 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbr1P48758 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms