Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-5P42582 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms