Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppm1bP36993 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppm1bP36993 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms