Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 TOS3YGL179C 1683 nt4.83□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 YDL027CYDL027C 1263 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 SPO16YHR153C 597 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 MNN11YJL183W 1269 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 VPS28YPL065W 729 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 YPR015CYPR015C 744 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 ATH1YPR026W 3636 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 GAS2YLR343W 1668 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 MUP3YHL036W 1641 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 SEG2YKL105C 3399 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 AKL1YBR059C 3327 nt4.82□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 RAD57YDR004W 1383 nt4.81□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 AIM10YER087W 1731 nt4.81□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 RFT1YBL020W 1725 nt4.81□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 TIM21YGR033C 720 nt4.81□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 HPM1YIL110W 1134 nt4.81□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.81□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 RPS0BYLR048W 759 nt4.81□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 SAP30YMR263W 606 nt4.81□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 YBR139WYBR139W 1527 nt4.81□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 HNT2YDR305C 654 nt4.8□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 JAC1YGL018C 555 nt4.8□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 GPP1YIL053W 753 nt4.8□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 ATP12YJL180C 978 nt4.8□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 OMA1YKR087C 1038 nt4.8□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 ATG14YBR128C 1035 nt4.8□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 PRP43YGL120C 2304 nt4.8□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.79□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 YIF1YNL263C 945 nt4.79□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 AIF1YNR074C 1137 nt4.79□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 PRM7YDL039C 2097 nt4.79□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 EKI1YDR147W 1605 nt4.79□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 SAP4YGL229C 2457 nt4.79□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 YPK3YBR028C 1578 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 PDR15YDR406W 4590 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 CBF5YLR175W 1452 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 UBC1YDR177W 648 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 SNA2YDR525W-A 240 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 CAX4YGR036C 720 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 YHL045WYHL045W 348 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 NMA1YLR328W 1206 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 YIM2YMR151W 438 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 LTO1YNL260C 597 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 PFA4YOL003C 1137 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 SAS10YDL153C 1833 nt4.78□□□□□ -1.64
YBL055CP34220 THI22YPR121W 1719 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 PMT5YDL093W 2232 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 GPR1YDL035C 2886 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 ZPR1YGR211W 1461 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 ARG82YDR173C 1068 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YFL068WYFL068W 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 LSM12YHR121W 564 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YLR036CYLR036C 612 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 URE2YNL229C 1065 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 MKS1YNL076W 1755 nt4.77□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 LDB17YDL146W 1476 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YHL012WYHL012W 1482 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 MRPL7YDR237W 879 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 DIN7YDR263C 1293 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 CNL1YDR357C 369 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 RIP1YEL024W 648 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 SAY1YGR263C 1275 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YKR047WYKR047W 306 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 BUD17YNR027W 954 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 UMP1YBR173C 447 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 ARC40YBR234C 1155 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 MDR1YGR100W 2853 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 YDL109CYDL109C 1944 nt4.76□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 ABD1YBR236C 1311 nt4.75□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 HSP82YPL240C 2130 nt4.75□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 ARF2YDL137W 546 nt4.75□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.75□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.75□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.75□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.75□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.75□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.75□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.75□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.75□□□□□ -1.65
YBL055CP34220 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.2 ms