Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfap2aP34056 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfap2aP34056 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfap2aP34056 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2aP34056 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2aP34056 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2aP34056 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2aP34056 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2aP34056 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2aP34056 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2aP34056 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2aP34056 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tfap2aP34056 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms