Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola2P33611 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola2P33611 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola2P33611 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola2P33611 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pola2P33611 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pola2P33611 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pola2P33611 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pola2P33611 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pola2P33611 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pola2P33611 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms