Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BgnP28653 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BgnP28653 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BgnP28653 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BgnP28653 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BgnP28653 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BgnP28653 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BgnP28653 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BgnP28653 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BgnP28653 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BgnP28653 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BgnP28653 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BgnP28653 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BgnP28653 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BgnP28653 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BgnP28653 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BgnP28653 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BgnP28653 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BgnP28653 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BgnP28653 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BgnP28653 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BgnP28653 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BgnP28653 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BgnP28653 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BgnP28653 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BgnP28653 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BgnP28653 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BgnP28653 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BgnP28653 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BgnP28653 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BgnP28653 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BgnP28653 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BgnP28653 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BgnP28653 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BgnP28653 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BgnP28653 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BgnP28653 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BgnP28653 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BgnP28653 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BgnP28653 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BgnP28653 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BgnP28653 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BgnP28653 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BgnP28653 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BgnP28653 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BgnP28653 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BgnP28653 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BgnP28653 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BgnP28653 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BgnP28653 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BgnP28653 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BgnP28653 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BgnP28653 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BgnP28653 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BgnP28653 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BgnP28653 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BgnP28653 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BgnP28653 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BgnP28653 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BgnP28653 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BgnP28653 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BgnP28653 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BgnP28653 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BgnP28653 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BgnP28653 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BgnP28653 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BgnP28653 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BgnP28653 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BgnP28653 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BgnP28653 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BgnP28653 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BgnP28653 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BgnP28653 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BgnP28653 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BgnP28653 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms