Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klra1P20937 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klra1P20937 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klra1P20937 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klra1P20937 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klra1P20937 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Klra1P20937 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klra1P20937 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klra1P20937 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klra1P20937 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klra1P20937 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klra1P20937 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klra1P20937 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klra1P20937 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klra1P20937 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klra1P20937 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klra1P20937 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klra1P20937 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klra1P20937 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klra1P20937 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klra1P20937 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Klra1P20937 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klra1P20937 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klra1P20937 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klra1P20937 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klra1P20937 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klra1P20937 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klra1P20937 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klra1P20937 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klra1P20937 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klra1P20937 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klra1P20937 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klra1P20937 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klra1P20937 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klra1P20937 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klra1P20937 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klra1P20937 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klra1P20937 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klra1P20937 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klra1P20937 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klra1P20937 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klra1P20937 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klra1P20937 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klra1P20937 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klra1P20937 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klra1P20937 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klra1P20937 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms