Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga5P11688 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga5P11688 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga5P11688 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga5P11688 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga5P11688 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms