Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLXNC1O60486 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms