Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag2O35638 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag2O35638 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag2O35638 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag2O35638 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag2O35638 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stag2O35638 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms