Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MttpO08601 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MttpO08601 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MttpO08601 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MttpO08601 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MttpO08601 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MttpO08601 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MttpO08601 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MttpO08601 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MttpO08601 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MttpO08601 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MttpO08601 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MttpO08601 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MttpO08601 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MttpO08601 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MttpO08601 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MttpO08601 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MttpO08601 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MttpO08601 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MttpO08601 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MttpO08601 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MttpO08601 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MttpO08601 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MttpO08601 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MttpO08601 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MttpO08601 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MttpO08601 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MttpO08601 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MttpO08601 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MttpO08601 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MttpO08601 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MttpO08601 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MttpO08601 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MttpO08601 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MttpO08601 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MttpO08601 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MttpO08601 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MttpO08601 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MttpO08601 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MttpO08601 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MttpO08601 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MttpO08601 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MttpO08601 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MttpO08601 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MttpO08601 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MttpO08601 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MttpO08601 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MttpO08601 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MttpO08601 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MttpO08601 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MttpO08601 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MttpO08601 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MttpO08601 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MttpO08601 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MttpO08601 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MttpO08601 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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