Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5849J3QPE5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm5849J3QPE5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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