Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG7

N4bp2, NEDD4-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2F8VQG7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4bp2F8VQG7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
N4bp2F8VQG7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4bp2F8VQG7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
N4bp2F8VQG7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms