Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3443F7CCV5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3443F7CCV5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms