Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3095E9Q058 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms