Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms