Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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